Μία από τις ιδιαιτερότητες του Kivotos Santorini, συγκριτικά με τα υπόλοιπα ξενοδοχεία της Σαντορίνης, είναι ότι το χρώμα του ξενοδοχείου εσωτερικά και εξωτερικά δεν είναι λευκό όπως σε όλα τα υπόλοιπα, άλλα ένα μοναδικό σκούρο γκρι προς μαύρο. Το χρώμα αυτό επιλέχθηκε, καθώς θέλαμε να συνδέσουμε το Kivotos με την ιστορία του ηφαιστείου της Σαντορίνης. H Σαντορίνη όπως την ξέρουμε σήμερα, δημιουργήθηκε από την έκρηξη του ηφαιστείου χιλιάδες χρόνια πριν. Για αυτόν τον λόγο δημιουργήθηκαν κάποιες ειδικές σχισμές στις θολωτές οροφές και τους τοίχους των σουιτών του ξενοδοχείου, μέσα από τις οποίες αναβλύζει φωτισμός RGBW, ο οποίος μπορεί να αλλάζει βάσει των προτιμήσεων του εκάστοτε πελάτη, μέσω του tablet του.
Ένα άλλο πολύ σημαντικό πλεονέκτημα του Kivotos είναι και η τοποθεσία του, καθώς βρίσκεται στο υψηλότερο σημείο της καλντέρας, στην καρδιά του Ημεροβιγλίου, προσφέροντας άμεση πρόσβαση στον πελάτη από το σημείο που θα αφήσει το αυτοκίνητό του, χωρίς να χρειάζεται να κατέβει τα αμέτρητα σκαλιά για να φτάσει στο δωμάτιό του, όπως στα περισσότερα ξενοδοχεία της Σαντορίνης. Από τις βεράντες των σουιτών μπορεί κανείς να απολαύσει την καλύτερη θέα στο ηλιοβασίλεμα, το ηφαίστειο, καθώς και τον Σκάρο ή αλλιώς την Ακρόπολη της Σαντορίνης, όπως το αποκαλούν κάποιοι.
Το Kivotos Santorini αποτελείται από τέσσερις Σουίτες (35-80 μ2) και μία Βίλα (200 μ2). Επίσης, υπάρχει η δυνατότητα συνένωσης 2 σουιτών και της Βίλας, με αποτέλεσμα να μπορεί να απολαύσει κάποιος τη μεγαλύτερη Βίλα της Σαντορίνης (350 μ2 εσωτερικός χώρος), με τρία υπνοδωμάτια, εσωτερική θερμαινόμενη πισίνα, εσωτερικό θερμαινόμενο Jacuzzi, εξωτερικό θερμαινόμενο Jacuzzi, κουζίνα για private cooking από τον Executive Chef του ξενοδοχείου, Hammam και χώρο για couples massage.